ほとんどの公務員に2016年12月9日、冬のボーナス（期末・勤勉手当）が支給された。上越市は一般職1873人と特別職に合計13億7894万円を支給。一般職の平均年齢は43歳9か月で、平均支給額は71万7000円。前年より約1万1000円増えた。
一般職の支給月数は県人事委員会の勧告に基づく給与改定等に準じた勤勉手当支給月数の引き上げにより、前年より0.050月分多い2.175か月。
市長のボーナスは約172万円、副市長は約130万円、教育長とガス水道事業管理者は約120万円。市議会議員は平均で約88万円。
